Livejurnal69 - Tim riset yang dipimpin oleh University of Washington fisikawan telah menemukan metode yang bekerja pada skala yang sangat kecil untuk DNA urutan cepat dan relatif murah.
Itu bisa membuka pintu untuk obat individual lebih efektif, misalnya memberikan cetak biru kecenderungan genetik untuk kondisi tertentu dan penyakit seperti kanker, diabetes atau kecanduan.
"Harapannya adalah bahwa pada orang 10 tahun akan memiliki semua DNA sequencing mereka, dan ini akan mengarah pada personalisasi, kedokteran prediktif," kata Jens Gundlach, seorang profesor fisika UW dan penulis utama dari kertas yang menggambarkan teknik baru menerbitkan minggu Agustus 16 dalam Prosiding National Academy of Sciences..
Teknik ini membuat pembaca DNA yang menggabungkan biologi dan nanoteknologi menggunakan nanopore diambil dari Mycobacterium smegmatis porin A. nanopore memiliki pembukaan 1000000000 dari satu meter dalam ukuran, cukup besar untuk mengukur untai tunggal DNA saat melewati.
Para ilmuwan menempatkan pori-pori di membran dikelilingi oleh larutan kalium-klorida. Sebuah tegangan yang kecil ini diterapkan untuk membuat ion saat ini mengalir melalui nanopore, dan tanda tangan listrik arus berubah tergantung pada nukleotida perjalanan melalui nanopore tersebut. Setiap nukleotida yang merupakan inti dari DNA - sitosin, guanin, adenin dan timin - menghasilkan tanda tangan yang berbeda.
Tim itu harus menyelesaikan dua masalah utama. Salah satunya adalah untuk menciptakan pembukaan pendek dan sempit cukup besar untuk memungkinkan satu untai DNA melewati nanopore dan hanya untuk satu molekul DNA tunggal berada dalam membuka setiap saat. Michael Niederweis di Universitas Alabama di Birmingham diubah bakteri M. smegmatis untuk menghasilkan pori-pori yang cocok.
Masalah kedua, Gundlach mengatakan, adalah bahwa nukleotida mengalir melalui nanopore pada tingkat setiap satu juta dari kedua terlalu cepat untuk menyortir sinyal dari setiap molekul DNA. Untuk kompensasi, para peneliti terlampir bagian DNA beruntai ganda antara setiap nukleotida yang mereka inginkan untuk mengukur. Alur kedua akan menangkap sebentar di tepi nanopore itu, menghentikan aliran DNA cukup lama untuk nukleotida tunggal yang akan diadakan dalam DNA nanopore pembaca. Setelah beberapa milidetik, bagian untai ganda akan terpisah dan mengalir terus sampai lain DNA untai ganda yang dihadapi, yang memungkinkan nukleotida berikutnya untuk dibaca.
Penundaan, meskipun diukur dalam perseribu detik, cukup panjang untuk membaca sinyal-sinyal listrik dari nukleotida target, Gundlach kata.
"Kita praktis bisa membaca urutan DNA dari sebuah osiloskop jejak," katanya.
Selain Gundlach dan Niederweiss, penulis lain adalah Ian Derrington, Tom Butler, Elizabeth Manrao dan Marcus Collins dari UW; dan Mikhail Pavlenok di Alabama-Birmingham.
Pekerjaan itu didanai oleh National Institutes of Health dan Genom Manusia Nasional Research Institute sebagai bagian dari program untuk menciptakan teknologi untuk urutan genom manusia $ 1.000 atau kurang. Program tersebut dimulai tahun 2004, ketika biaya atas perintah $ 10 juta untuk urutan genom manusia berukuran.
Penelitian baru ini adalah langkah besar untuk mencapai sekuensing DNA dengan biaya sebesar $ 1.000 atau kurang.
"Percobaan kami outline sebuah novel yang sangat sederhana dan mendasar teknologi sekuensing yang kami harap kini dapat diperluas ke dalam suatu proses mekanik," kata Gundlach.
Itu bisa membuka pintu untuk obat individual lebih efektif, misalnya memberikan cetak biru kecenderungan genetik untuk kondisi tertentu dan penyakit seperti kanker, diabetes atau kecanduan.
"Harapannya adalah bahwa pada orang 10 tahun akan memiliki semua DNA sequencing mereka, dan ini akan mengarah pada personalisasi, kedokteran prediktif," kata Jens Gundlach, seorang profesor fisika UW dan penulis utama dari kertas yang menggambarkan teknik baru menerbitkan minggu Agustus 16 dalam Prosiding National Academy of Sciences..
Teknik ini membuat pembaca DNA yang menggabungkan biologi dan nanoteknologi menggunakan nanopore diambil dari Mycobacterium smegmatis porin A. nanopore memiliki pembukaan 1000000000 dari satu meter dalam ukuran, cukup besar untuk mengukur untai tunggal DNA saat melewati.
Para ilmuwan menempatkan pori-pori di membran dikelilingi oleh larutan kalium-klorida. Sebuah tegangan yang kecil ini diterapkan untuk membuat ion saat ini mengalir melalui nanopore, dan tanda tangan listrik arus berubah tergantung pada nukleotida perjalanan melalui nanopore tersebut. Setiap nukleotida yang merupakan inti dari DNA - sitosin, guanin, adenin dan timin - menghasilkan tanda tangan yang berbeda.
Tim itu harus menyelesaikan dua masalah utama. Salah satunya adalah untuk menciptakan pembukaan pendek dan sempit cukup besar untuk memungkinkan satu untai DNA melewati nanopore dan hanya untuk satu molekul DNA tunggal berada dalam membuka setiap saat. Michael Niederweis di Universitas Alabama di Birmingham diubah bakteri M. smegmatis untuk menghasilkan pori-pori yang cocok.
Masalah kedua, Gundlach mengatakan, adalah bahwa nukleotida mengalir melalui nanopore pada tingkat setiap satu juta dari kedua terlalu cepat untuk menyortir sinyal dari setiap molekul DNA. Untuk kompensasi, para peneliti terlampir bagian DNA beruntai ganda antara setiap nukleotida yang mereka inginkan untuk mengukur. Alur kedua akan menangkap sebentar di tepi nanopore itu, menghentikan aliran DNA cukup lama untuk nukleotida tunggal yang akan diadakan dalam DNA nanopore pembaca. Setelah beberapa milidetik, bagian untai ganda akan terpisah dan mengalir terus sampai lain DNA untai ganda yang dihadapi, yang memungkinkan nukleotida berikutnya untuk dibaca.
Penundaan, meskipun diukur dalam perseribu detik, cukup panjang untuk membaca sinyal-sinyal listrik dari nukleotida target, Gundlach kata.
"Kita praktis bisa membaca urutan DNA dari sebuah osiloskop jejak," katanya.
Selain Gundlach dan Niederweiss, penulis lain adalah Ian Derrington, Tom Butler, Elizabeth Manrao dan Marcus Collins dari UW; dan Mikhail Pavlenok di Alabama-Birmingham.
Pekerjaan itu didanai oleh National Institutes of Health dan Genom Manusia Nasional Research Institute sebagai bagian dari program untuk menciptakan teknologi untuk urutan genom manusia $ 1.000 atau kurang. Program tersebut dimulai tahun 2004, ketika biaya atas perintah $ 10 juta untuk urutan genom manusia berukuran.
Penelitian baru ini adalah langkah besar untuk mencapai sekuensing DNA dengan biaya sebesar $ 1.000 atau kurang.
"Percobaan kami outline sebuah novel yang sangat sederhana dan mendasar teknologi sekuensing yang kami harap kini dapat diperluas ke dalam suatu proses mekanik," kata Gundlach.
0 komentar:
Posting Komentar
Sahabat yang budiman jangan lupa Setelah membaca untuk memberikan komentar.Jika Sobat Suka Akan Artikelnya Mohon Like Google +1 nya.
Komentar yang berbau sara,fornografi,menghina salah satu kelompok,suku dan agama serta yang bersifat SPAM dan LINK karena akan kami hapus.Terima Kasih Atas Pengertiannya