Livejurnal69 - Ujian statistik yang paling kuat untuk tanggal link genetik spesies kita 'untuk "Hawa mitokondria" - nenek moyang ibu dari semua manusia hidup - menegaskan bahwa ia hidup sekitar 200.000 tahun yang lalu. Rice Universitas didasarkan pada studi perbandingan sisi-by-side dari 10 model genetik manusia masing-masing yang bertujuan untuk menentukan kapan Hawa tinggal menggunakan set sangat berbeda dari asumsi tentang cara manusia bermigrasi, diperluas dan tersebar di Bumi.
Penelitian ini tersedia online dalam jurnal Penduduk Biologi Teoritis."Temuan kami menggarisbawahi pentingnya dengan mempertimbangkan sifat acak proses seperti pertumbuhan populasi dan kepunahan," kata rekan penulis studi Marek Kimmel, profesor statistik di Rice. "Klasik, model deterministik, termasuk beberapa yang sebelumnya telah diterapkan pada kencan Hawa mitokondria, melakukan account tidak sepenuhnya untuk proses-proses acak."
Pencarian sampai saat Hawa mitokondria (mtEve) adalah contoh dari cara para ilmuwan probe genetik masa lalu untuk mempelajari lebih lanjut tentang mutasi, seleksi dan lain proses genetik yang memainkan peran kunci dalam penyakit.
"Inilah sebabnya mengapa kami tertarik pada pola variabilitas genetik secara umum," kata Kimmel. "Mereka sangat penting untuk obat."
Misalnya, cara para ilmuwan mencoba untuk mtEve tanggal bergantung pada teknik-teknik genetik modern. Profil genetik donor darah acak dibandingkan, dan berdasarkan kemiripan dan perbedaan antara gen-gen tertentu, para ilmuwan dapat menetapkan nomor yang menggambarkan tingkat yang setiap dua donor yang terkait satu sama lain.
Menggunakan genom mitokondria untuk mengukur keterkaitan adalah cara untuk genetika untuk menyederhanakan tugas mencari nenek moyang yang sama yang hidup lama. Itu karena seluruh genom manusia mengandung lebih dari 20.000 gen, dan membandingkan perbedaan antara gen begitu banyak untuk kerabat jauh adalah masalah, bahkan dengan saat ini terbesar dan superkomputer tercepat.
Tetapi mitokondria - yang organel kecil yang berfungsi sebagai pabrik energi di dalam semua sel manusia - memiliki genom mereka sendiri. Selain mengandung 37 gen yang jarang berubah, mereka berisi "hipervariabel" daerah, yang berubah cukup cepat untuk memberikan sebuah jam molekuler dikalibrasi untuk kali dibandingkan dengan umur manusia modern. Karena genom mitokondria setiap orang diwariskan dari ibu-nya, semua garis keturunan mitokondria adalah ibu.
Untuk menyimpulkan mtEve usia, para ilmuwan harus mengubah ukuran keterkaitan antara donor darah acak ke dalam ukuran waktu.
"Anda harus menerjemahkan perbedaan antara sekuens gen ke dalam bagaimana mereka berevolusi pada waktunya," kata co-penulis Krzysztof Cyran, wakil kepala Institut Informatika di Silesian University of Technology di Gliwice, Polandia. "Dan bagaimana mereka berevolusi dalam waktu tergantung pada model evolusi yang Anda gunakan. Jadi, misalnya, apa yang laju mutasi genetik, dan tingkat perubahan yang seragam dalam waktu? Dan bagaimana proses hilangnya genetik secara acak varian, yang kita sebut pergeseran genetik? "
Dalam masing-masing model, jawaban atas pertanyaan-pertanyaan berbentuk koefisien - konstanta numerik yang terhubung ke dalam persamaan yang mengembalikan jawaban ketika mtEve tinggal.
Setiap model memiliki asumsi sendiri, dan asumsi masing-masing memiliki implikasi matematika. Untuk lebih rumit, beberapa asumsi tersebut tidak berlaku untuk populasi manusia. Sebagai contoh, beberapa model mengasumsikan bahwa ukuran populasi tidak pernah berubah. Itu tidak benar bagi manusia, yang penduduknya telah berkembang pesat setidaknya beberapa ribu generasi. Model-model lain menganggap pencampuran gen sempurna, yang berarti bahwa setiap dua manusia di manapun di dunia memiliki peluang yang sama untuk menghasilkan keturunan.
Cyran kata model genetik manusia menjadi lebih kompleks selama beberapa dekade sebagai teoretikus telah mencoba untuk mengoreksi asumsi-asumsi yang tidak valid. Tetapi beberapa dari koreksi - seperti menambahkan branching proses yang berusaha menangkap dinamika pertumbuhan penduduk di migrasi manusia awal - yang sangat kompleks. Yang menimbulkan pertanyaan apakah model yang kurang kompleks mungkin dilakukan sama baiknya dalam menangkap apa yang terjadi.
"Kami ingin melihat seberapa sensitif perkiraan adalah untuk asumsi model," kata Kimmel. "Kami menemukan bahwa semua model yang dicatat ukuran populasi acak - seperti proses percabangan berbeda - memberikan perkiraan yang sama. Hal ini meyakinkan, karena hal ini menunjukkan bahwa menyempurnakan asumsi model, melebihi suatu titik tertentu, mungkin tidak yang penting dalam gambaran besar. "
Penelitian ini didukung oleh hibah dari Departemen Ilmu dan Polandia Pendidikan Tinggi dan Pencegahan Kanker dan Institut Penelitian Texas. Hal ini telah menghasilkan dari kolaborasi berdiri antara Rice University dan Universitas Teknologi Silesia.
Penelitian ini tersedia online dalam jurnal Penduduk Biologi Teoritis."Temuan kami menggarisbawahi pentingnya dengan mempertimbangkan sifat acak proses seperti pertumbuhan populasi dan kepunahan," kata rekan penulis studi Marek Kimmel, profesor statistik di Rice. "Klasik, model deterministik, termasuk beberapa yang sebelumnya telah diterapkan pada kencan Hawa mitokondria, melakukan account tidak sepenuhnya untuk proses-proses acak."
Pencarian sampai saat Hawa mitokondria (mtEve) adalah contoh dari cara para ilmuwan probe genetik masa lalu untuk mempelajari lebih lanjut tentang mutasi, seleksi dan lain proses genetik yang memainkan peran kunci dalam penyakit.
"Inilah sebabnya mengapa kami tertarik pada pola variabilitas genetik secara umum," kata Kimmel. "Mereka sangat penting untuk obat."
Misalnya, cara para ilmuwan mencoba untuk mtEve tanggal bergantung pada teknik-teknik genetik modern. Profil genetik donor darah acak dibandingkan, dan berdasarkan kemiripan dan perbedaan antara gen-gen tertentu, para ilmuwan dapat menetapkan nomor yang menggambarkan tingkat yang setiap dua donor yang terkait satu sama lain.
Menggunakan genom mitokondria untuk mengukur keterkaitan adalah cara untuk genetika untuk menyederhanakan tugas mencari nenek moyang yang sama yang hidup lama. Itu karena seluruh genom manusia mengandung lebih dari 20.000 gen, dan membandingkan perbedaan antara gen begitu banyak untuk kerabat jauh adalah masalah, bahkan dengan saat ini terbesar dan superkomputer tercepat.
Tetapi mitokondria - yang organel kecil yang berfungsi sebagai pabrik energi di dalam semua sel manusia - memiliki genom mereka sendiri. Selain mengandung 37 gen yang jarang berubah, mereka berisi "hipervariabel" daerah, yang berubah cukup cepat untuk memberikan sebuah jam molekuler dikalibrasi untuk kali dibandingkan dengan umur manusia modern. Karena genom mitokondria setiap orang diwariskan dari ibu-nya, semua garis keturunan mitokondria adalah ibu.
Untuk menyimpulkan mtEve usia, para ilmuwan harus mengubah ukuran keterkaitan antara donor darah acak ke dalam ukuran waktu.
"Anda harus menerjemahkan perbedaan antara sekuens gen ke dalam bagaimana mereka berevolusi pada waktunya," kata co-penulis Krzysztof Cyran, wakil kepala Institut Informatika di Silesian University of Technology di Gliwice, Polandia. "Dan bagaimana mereka berevolusi dalam waktu tergantung pada model evolusi yang Anda gunakan. Jadi, misalnya, apa yang laju mutasi genetik, dan tingkat perubahan yang seragam dalam waktu? Dan bagaimana proses hilangnya genetik secara acak varian, yang kita sebut pergeseran genetik? "
Dalam masing-masing model, jawaban atas pertanyaan-pertanyaan berbentuk koefisien - konstanta numerik yang terhubung ke dalam persamaan yang mengembalikan jawaban ketika mtEve tinggal.
Setiap model memiliki asumsi sendiri, dan asumsi masing-masing memiliki implikasi matematika. Untuk lebih rumit, beberapa asumsi tersebut tidak berlaku untuk populasi manusia. Sebagai contoh, beberapa model mengasumsikan bahwa ukuran populasi tidak pernah berubah. Itu tidak benar bagi manusia, yang penduduknya telah berkembang pesat setidaknya beberapa ribu generasi. Model-model lain menganggap pencampuran gen sempurna, yang berarti bahwa setiap dua manusia di manapun di dunia memiliki peluang yang sama untuk menghasilkan keturunan.
Cyran kata model genetik manusia menjadi lebih kompleks selama beberapa dekade sebagai teoretikus telah mencoba untuk mengoreksi asumsi-asumsi yang tidak valid. Tetapi beberapa dari koreksi - seperti menambahkan branching proses yang berusaha menangkap dinamika pertumbuhan penduduk di migrasi manusia awal - yang sangat kompleks. Yang menimbulkan pertanyaan apakah model yang kurang kompleks mungkin dilakukan sama baiknya dalam menangkap apa yang terjadi.
"Kami ingin melihat seberapa sensitif perkiraan adalah untuk asumsi model," kata Kimmel. "Kami menemukan bahwa semua model yang dicatat ukuran populasi acak - seperti proses percabangan berbeda - memberikan perkiraan yang sama. Hal ini meyakinkan, karena hal ini menunjukkan bahwa menyempurnakan asumsi model, melebihi suatu titik tertentu, mungkin tidak yang penting dalam gambaran besar. "
Penelitian ini didukung oleh hibah dari Departemen Ilmu dan Polandia Pendidikan Tinggi dan Pencegahan Kanker dan Institut Penelitian Texas. Hal ini telah menghasilkan dari kolaborasi berdiri antara Rice University dan Universitas Teknologi Silesia.
0 komentar:
Posting Komentar
Sahabat yang budiman jangan lupa Setelah membaca untuk memberikan komentar.Jika Sobat Suka Akan Artikelnya Mohon Like Google +1 nya.
Komentar yang berbau sara,fornografi,menghina salah satu kelompok,suku dan agama serta yang bersifat SPAM dan LINK karena akan kami hapus.Terima Kasih Atas Pengertiannya