Ditemukan Viral tak terduga di genom Vertebrata 'Fosil'

Over millions of years, retroviruses, which insert their genetic material into the host genome as part of their replication, have left behind bits of their genetic material in vertebrate genomes. In a recent study, published July 29 in the open-access journal PLoS Pathogens, a team of researchers have now found that human and other vertebrate genomes also contain many ancient sequences from Ebola/Marburgviruses and Bornaviruses -- two deadly virus families.

Karena tidak memasukkan bahan genetik virus keluarga mereka ke dalam genom inang saat replikasi, sebagai retrovirus lakukan, penemuan itu semua lebih tak terduga.

"Ini adalah kejutan bagi kami," kata penulis Anna Marie Skalka, Ph.D., Direktur Emerita dari Institute for Cancer Research di Fox Chase Cancer. "Ia mengatakan bahwa sumber bahan genetik kita adalah jauh lebih luas daripada yang kita pikir ini mencakup gen kita sendiri dan gen virus tak terduga juga.."

Tim, yang termasuk penulis utama Vladimir A. Belyi, Ph.D., dan co-penulis Arnold J. Levine, Ph.D., baik di Institute for Advanced Study di Princeton, dibandingkan 5.666 gen virus dari semua yang dikenal non- retroviral keluarga dengan genom RNA beruntai tunggal ke genom dari 48 spesies vertebrata, termasuk manusia. Dengan demikian, mereka menemukan integrasi terpisah urutan 80 virus menjadi 19 spesies vertebrata yang berbeda. Menariknya, hampir semua sekuens virus berasal dari keluarga kuno hanya dua keluarga virus, Ebola / Marburgviruses dan Bornaviruses, yang keduanya menyebabkan demam berdarah dan penyakit saraf.

"Virus ini RNA virus," kata Skalka. "Mereka meniru mereka RNA dan tidak dikenal untuk membuat DNA, Dan mereka tidak memiliki mekanisme dikenal untuk mendapatkan bahan genetik mereka diintegrasikan ke dalam DNA dari genom tuan rumah.. Memang, beberapa dari mereka bahkan tidak masuk ke inti ketika mereka meniru. "

Bahwa urutan, beberapa yang mungkin telah diintegrasikan ke dalam genom lebih dari 40 juta tahun yang lalu, telah banyak dikonservasi evolusi dari waktu ke waktu menunjukkan bahwa mereka memberi tuan rumah keunggulan selektif, mungkin melindungi mereka dari infeksi masa depan oleh virus dari keluarga-keluarga. Studi ini menunjukkan bahwa integrasi dari urutan virus kuno mungkin dimediasi oleh unsur-unsur bergerak, Lines, yang melimpah di genom mamalia.

"Di satu sisi, satu bahkan mungkin berpikir integrasi ini sebagai vaksinasi genomik," kata Skalka.

Menunjukkan secara meyakinkan bahwa urutan virus memiliki beberapa fungsi biologis akan mengambil pekerjaan tambahan. Namun, tim telah mencatat bahwa ekspresi dari beberapa frame membaca terbuka virus telah terdeteksi dalam jaringan manusia, yang mendukung kemungkinan bahwa mereka secara biologis aktif dalam spesies inang.