Livejurnal69 - Setelah memetakan terjadinya perubahan kimia umum yang terjadi ketika sel-sel induk menentukan nasib mereka dan kemajuan dari pendahulu progeni, tim Johns Hopkins yang dipimpin ilmuwan telah menghasilkan peta lanskap pertama yang epigenetik untuk diferensiasi jaringan.
Rincian dari studi kolaboratif antara Johns Hopkins, Stanford dan Harvard muncul Agustus 15 di awal publikasi online Alam.
Para peneliti, menggunakan darah pembentuk sel induk dari tikus, fokus investigasi mereka secara khusus pada tanda epigenetik dikenal sebagai metilasi. Perubahan ini ditemukan di salah satu blok bangunan DNA, dikenang oleh sel ketika membagi, dan sering dikaitkan dengan mematikan gen.
Menggunakan metode metilasi-profil disesuaikan genome disebut CHARM (array tinggi-throughput komprehensif untuk metilasi relatif), tim yang dianalisis 4.600.000 berpotensi dimetilasi situs dalam berbagai sel-sel darah dari tikus untuk melihat di mana metilasi DNA perubahan terjadi selama diferensiasi normal proses. Tim memilih sistem sel darah sebagai model karena sudah sangat dipahami dalam hal pengembangan seluler.
Mereka menatap delapan jenis sel dalam berbagai tahap komitmen, termasuk darah yang sangat dini sel induk yang belum berdiferensiasi menjadi sel darah merah dan putih. Mereka juga melihat sel-sel yang lebih berkomitmen untuk diferensiasi: pelopor dari dua jenis utama dari sel darah putih, limfosit dan sel myeloid. Akhirnya, mereka melihat sel-sel tua yang dekat dengan nasib akhir mereka untuk mendapatkan gambar yang lebih lengkap tentang hubungan prekursor-progeni - misalnya, di sel-sel darah putih yang sudah cukup jauh dalam pembangunan limfosit T-sel. (Limfoid dan myeloid merupakan dua jenis utama dari sel darah nenek moyang.)
"Itu bukan pohon yang lengkap, tapi itu sebagian besar pohon, dan cabang-cabang yang berbeda," kata Andrew Feinberg, MD, MPH, Raja Fahd Profesor Molekuler Kedokteran dan direktur Pusat Epigenetik di Hopkins 'Institute for Dasar Ilmu Pengetahuan Biomedis.
"Gen itu sendiri tidak akan memberi tahu kami apa yang benar-benar bertanggung jawab atas keragaman besar dalam jenis sel dalam organisme yang kompleks seperti kita," ujar Feinberg. "Tapi saya rasa Epigenetik - dan bagaimana kontrol gen-dapat. Itu sebabnya kami ingin tahu apa yang terjadi secara umum untuk tingkat metilasi DNA sebagai sel membedakan."
Salah satu menemukan mengejutkan adalah bagaimana pola metilasi DNA luas bervariasi dalam sel sebagai mereka membedakan. "Itu bukan proses linear membosankan," kata Feinberg. "Sebaliknya, kita melihat gelombang ini perubahan selama pengembangan jenis sel."
Data tersebut menunjukkan bahwa ketika semua dikatakan dan dilakukan, limfosit memiliki gen lebih banyak alkohol dibandingkan sel myeloid. Namun, dalam perjalanan untuk menjadi sangat dimetilasi, limfosit mengalami gelombang besar kehilangan metilasi DNA awal dalam pengembangan dan kemudian kembali dari metilasi. Sel myeloid, di sisi lain, menjalani gelombang metilasi meningkat awal dalam pembangunan dan kemudian menghapus metilasi yang kemudian dalam pembangunan.
Dasar seperti itu, peta ini pemandangan pertama epigenetik memiliki daya prediksi dalam arah sebaliknya, menurut Feinberg. Tim ini bisa membedakan jenis sel batang sel darah datang dari, karena sel-sel darah epigenetically belum sepenuhnya melepaskan masa lalu mereka; mereka sisa noda yang menjadi karakteristik dari garis keturunan mereka.
Proyek ini melibatkan repertoar dari bakat. "Tidak ada yang lebih yang tidak terpisahkan dari Irv Weissman di Stanford," kata Feinberg. "Dia seorang ahli biologi sel batang yang besar dan ia meminjamkan seluruh tingkat keahlian yang kami tidak punya."
Satu aplikasi nyata dari pekerjaan ini mungkin untuk menggunakan teknik-teknik yang sama untuk menilai seberapa benar-benar sebuah sel induk yang disebabkan pluripotent (iPSC) telah diprogram kembali.
"Anda mungkin ingin memiliki jenis sel tidak lengkap diprogram kembali dari darah, misalnya, bahwa Anda hanya butuh untuk suatu titik tertentu karena Anda ingin mengubahnya menjadi berbagai jenis sel darah," kata Feinberg, memperingatkan bahwa berbagai aplikasi sangat teoritis.
Karena data tampaknya menunjukkan tahap diferensiasi sel mencolok ditandai oleh gelombang perubahan satu arah dan gelombang berikutnya di tempat lain, jenis sel menurut pikiran dapat didefinisikan kembali sesuai dengan tanda epigenetik yang akan memberikan wawasan baru ke dalam perkembangan yang normal dan baik proses penyakit.
"Leukemia dan limfoma mungkin melibatkan gangguan dari lanskap epigenetik," kata Feinberg. "Seperti peta epigenetik seperti ini mulai mendapatkan fleshed oleh kita dan orang lain, mereka akan memandu pemahaman kita tentang mengapa penyakit berperilaku seperti yang mereka lakukan, dan membuka jalan bagi terapi baru."
Penelitian ini didukung oleh Institut Kesehatan Nasional dan hibah dari Thomas dan Stacey Siebel Foundation.
Johns Hopkins penulis, selain Feinberg, adalah Hong Ji, Peter Murakami, Akiko Doi, Hwajin Lee, Martin J. Aryee, dan Rafael A. Irizarry. penulis lain adalah Lauren IR Ehrlich, Juni Seita, Paulus Lindau, Derrick J Rossi, Matius A. Inlay, Thomas Serwold, Holger Karsunky, Ho Lena, dan Irving L. Weissman, semua dari Stanford University, dan Kitai Kim dan George Q. Daley , keduanya dari Harvard University.
Rincian dari studi kolaboratif antara Johns Hopkins, Stanford dan Harvard muncul Agustus 15 di awal publikasi online Alam.
Para peneliti, menggunakan darah pembentuk sel induk dari tikus, fokus investigasi mereka secara khusus pada tanda epigenetik dikenal sebagai metilasi. Perubahan ini ditemukan di salah satu blok bangunan DNA, dikenang oleh sel ketika membagi, dan sering dikaitkan dengan mematikan gen.
Menggunakan metode metilasi-profil disesuaikan genome disebut CHARM (array tinggi-throughput komprehensif untuk metilasi relatif), tim yang dianalisis 4.600.000 berpotensi dimetilasi situs dalam berbagai sel-sel darah dari tikus untuk melihat di mana metilasi DNA perubahan terjadi selama diferensiasi normal proses. Tim memilih sistem sel darah sebagai model karena sudah sangat dipahami dalam hal pengembangan seluler.
Mereka menatap delapan jenis sel dalam berbagai tahap komitmen, termasuk darah yang sangat dini sel induk yang belum berdiferensiasi menjadi sel darah merah dan putih. Mereka juga melihat sel-sel yang lebih berkomitmen untuk diferensiasi: pelopor dari dua jenis utama dari sel darah putih, limfosit dan sel myeloid. Akhirnya, mereka melihat sel-sel tua yang dekat dengan nasib akhir mereka untuk mendapatkan gambar yang lebih lengkap tentang hubungan prekursor-progeni - misalnya, di sel-sel darah putih yang sudah cukup jauh dalam pembangunan limfosit T-sel. (Limfoid dan myeloid merupakan dua jenis utama dari sel darah nenek moyang.)
"Itu bukan pohon yang lengkap, tapi itu sebagian besar pohon, dan cabang-cabang yang berbeda," kata Andrew Feinberg, MD, MPH, Raja Fahd Profesor Molekuler Kedokteran dan direktur Pusat Epigenetik di Hopkins 'Institute for Dasar Ilmu Pengetahuan Biomedis.
"Gen itu sendiri tidak akan memberi tahu kami apa yang benar-benar bertanggung jawab atas keragaman besar dalam jenis sel dalam organisme yang kompleks seperti kita," ujar Feinberg. "Tapi saya rasa Epigenetik - dan bagaimana kontrol gen-dapat. Itu sebabnya kami ingin tahu apa yang terjadi secara umum untuk tingkat metilasi DNA sebagai sel membedakan."
Salah satu menemukan mengejutkan adalah bagaimana pola metilasi DNA luas bervariasi dalam sel sebagai mereka membedakan. "Itu bukan proses linear membosankan," kata Feinberg. "Sebaliknya, kita melihat gelombang ini perubahan selama pengembangan jenis sel."
Data tersebut menunjukkan bahwa ketika semua dikatakan dan dilakukan, limfosit memiliki gen lebih banyak alkohol dibandingkan sel myeloid. Namun, dalam perjalanan untuk menjadi sangat dimetilasi, limfosit mengalami gelombang besar kehilangan metilasi DNA awal dalam pengembangan dan kemudian kembali dari metilasi. Sel myeloid, di sisi lain, menjalani gelombang metilasi meningkat awal dalam pembangunan dan kemudian menghapus metilasi yang kemudian dalam pembangunan.
Dasar seperti itu, peta ini pemandangan pertama epigenetik memiliki daya prediksi dalam arah sebaliknya, menurut Feinberg. Tim ini bisa membedakan jenis sel batang sel darah datang dari, karena sel-sel darah epigenetically belum sepenuhnya melepaskan masa lalu mereka; mereka sisa noda yang menjadi karakteristik dari garis keturunan mereka.
Proyek ini melibatkan repertoar dari bakat. "Tidak ada yang lebih yang tidak terpisahkan dari Irv Weissman di Stanford," kata Feinberg. "Dia seorang ahli biologi sel batang yang besar dan ia meminjamkan seluruh tingkat keahlian yang kami tidak punya."
Satu aplikasi nyata dari pekerjaan ini mungkin untuk menggunakan teknik-teknik yang sama untuk menilai seberapa benar-benar sebuah sel induk yang disebabkan pluripotent (iPSC) telah diprogram kembali.
"Anda mungkin ingin memiliki jenis sel tidak lengkap diprogram kembali dari darah, misalnya, bahwa Anda hanya butuh untuk suatu titik tertentu karena Anda ingin mengubahnya menjadi berbagai jenis sel darah," kata Feinberg, memperingatkan bahwa berbagai aplikasi sangat teoritis.
Karena data tampaknya menunjukkan tahap diferensiasi sel mencolok ditandai oleh gelombang perubahan satu arah dan gelombang berikutnya di tempat lain, jenis sel menurut pikiran dapat didefinisikan kembali sesuai dengan tanda epigenetik yang akan memberikan wawasan baru ke dalam perkembangan yang normal dan baik proses penyakit.
"Leukemia dan limfoma mungkin melibatkan gangguan dari lanskap epigenetik," kata Feinberg. "Seperti peta epigenetik seperti ini mulai mendapatkan fleshed oleh kita dan orang lain, mereka akan memandu pemahaman kita tentang mengapa penyakit berperilaku seperti yang mereka lakukan, dan membuka jalan bagi terapi baru."
Penelitian ini didukung oleh Institut Kesehatan Nasional dan hibah dari Thomas dan Stacey Siebel Foundation.
Johns Hopkins penulis, selain Feinberg, adalah Hong Ji, Peter Murakami, Akiko Doi, Hwajin Lee, Martin J. Aryee, dan Rafael A. Irizarry. penulis lain adalah Lauren IR Ehrlich, Juni Seita, Paulus Lindau, Derrick J Rossi, Matius A. Inlay, Thomas Serwold, Holger Karsunky, Ho Lena, dan Irving L. Weissman, semua dari Stanford University, dan Kitai Kim dan George Q. Daley , keduanya dari Harvard University.
0 komentar:
Posting Komentar
Sahabat yang budiman jangan lupa Setelah membaca untuk memberikan komentar.Jika Sobat Suka Akan Artikelnya Mohon Like Google +1 nya.
Komentar yang berbau sara,fornografi,menghina salah satu kelompok,suku dan agama serta yang bersifat SPAM dan LINK karena akan kami hapus.Terima Kasih Atas Pengertiannya